Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Foxd1Q61345 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxd1Q61345 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms