Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Igbp1Q61249 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igbp1Q61249 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igbp1Q61249 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms