Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mkrn3Q60764 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Mkrn3Q60764 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Mkrn3Q60764 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Mkrn3Q60764 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mkrn3Q60764 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mkrn3Q60764 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mkrn3Q60764 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms