Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms