Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PtprnQ60673 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PtprnQ60673 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PtprnQ60673 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PtprnQ60673 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PtprnQ60673 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PtprnQ60673 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprnQ60673 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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