Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf15Q5UBV8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf15Q5UBV8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf15Q5UBV8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf15Q5UBV8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf15Q5UBV8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf15Q5UBV8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf15Q5UBV8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf15Q5UBV8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Tnfsf15Q5UBV8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms