Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf145Q5SWK7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf145Q5SWK7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf145Q5SWK7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf145Q5SWK7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms