Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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