Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tns3Q5SSZ5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tns3Q5SSZ5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms