Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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