Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms