Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms