Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2al1nQ497L1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms