Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ttc9Q3V038 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ttc9Q3V038 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ttc9Q3V038 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ttc9Q3V038 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ttc9Q3V038 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ttc9Q3V038 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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