Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp30Q3UN04 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp30Q3UN04 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp30Q3UN04 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp30Q3UN04 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp30Q3UN04 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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