Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mccc2Q3ULD5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms