Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp19Q3UJD6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms