Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b2Q3UJB0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms