Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nkx6-3Q3UHX8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Nkx6-3Q3UHX8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Nkx6-3Q3UHX8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Nkx6-3Q3UHX8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Nkx6-3Q3UHX8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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