Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms