Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms