Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q3U6N9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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