Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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