Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hace1Q3U0D9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms