Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms