Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdlim7Q3TJD7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms