Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RubcnlQ3TD16 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms