Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prr27Q3SYJ2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms