Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtl9Q32KG4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rtl9Q32KG4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rtl9Q32KG4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rtl9Q32KG4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rtl9Q32KG4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rtl9Q32KG4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rtl9Q32KG4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rtl9Q32KG4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rtl9Q32KG4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl9Q32KG4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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