Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms