Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms