Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83bQ0VBM2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms