Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Itgb8Q0VBD0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms