Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5cQ0V8T7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cntnap5cQ0V8T7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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