Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc4Q08624 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms