Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Calb2Q08331 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Calb2Q08331 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Calb2Q08331 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Calb2Q08331 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Calb2Q08331 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Calb2Q08331 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Calb2Q08331 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Calb2Q08331 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Calb2Q08331 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Calb2Q08331 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Calb2Q08331 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Calb2Q08331 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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