Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm3Q08189 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms