Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms