Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox10Q04888 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms