Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms