Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms