Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GscQ02591 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GscQ02591 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GscQ02591 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms