Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VcpQ01853 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms