Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cacna1cQ01815 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms