Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgcrQ01237 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms