Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2bQ01097 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms