Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Itga4Q00651 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms