Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms