Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pitx2P97474 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms