Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms